El Consejo Directivo, es el Órgano de Gobierno que está encargado de la programación, supervisión, control y evaluación de la operación interna de la Dirección General de Protección al Colono, y le corresponde aprobar el:
- Nombramiento de los servidores públicos de nivel directivo de la Dirección General de Protección al Colono.
 - Dictar los lineamientos, normas y políticas que debe observar el Director para el funcionamiento del organismo.
 - Vigilar el cumplimiento de las obligaciones.
 - Diseñar y aplicar sistemas de evaluación de los resultados.
 - Conocer y en su caso aprobar los informes de actividades mensuales del Director.
 - Revisar, aprobar y, en su caso, modificar los planes y programas.
 - Autorizar el proyecto de presupuesto de ingresos y egresos, así como, vigilar su cumplimiento.
 - Vigilar la situación financiera y patrimonial, aprobar los estados financieros.
 - Vigilar que se publiquen anualmente los estados financieros del organismo.
 
